Le Centre de Génétique Médicale de Marseille a pour ambition de contribuer à une meilleure compréhension des pathologies génétiques rares, ainsi que l'exploration de leurs conséquences phénotypiques et cellulaires.

L'objectif est de développer des outils permettant leur diagnostic précis, l'optimisation de la prise en charge des patients et la prévention de ces maladies.

Focus sur les équipes de recherche touchant à la thématique IA/Santé

 

Les avancées technologiques et l'accumulation associée de bases de données biomédicales offrent des opportunités sans précédent pour mieux comprendre les systèmes biologiques dans des états sains et pathologiques. 

L'équipe de Biomédecine des Systèmes vise à exploiter ces données à grande échelle afin de mieux comprendre les maladies génétiques. Pour atteindre cet objectif, l'équipe développe et applique des approches numériques pour l'analyse et l'intégration de données biologiques multimodales.

Axes de Recherche : 

  • Développement récent d'un algorithme d’apprentissage par transfert pour l'intégration de données multi-omiques via la factorisation de matrices,
  • Exploration de stratégies d'apprentissage de représentations par graphe pour le repositionnement de médicaments,
  • Études en biologie des systèmes pour mieux comprendre le rôle cellulaire des protéines impliquées dans les myopathies et les maladies de vieillissement.

 

L’équipe de Biomédecine des Systèmes accueille le groupe de recherche de Paul Villoutreix, lauréat d'une Chaire de Professeur Junior INSERM.

 

La biologie des systèmes, qui considère les systèmes biologiques comme des réseaux d’interactions entre composants biologiques, propose une nouvelle approche pour relier les génotypes (ex. : gènes et protéines, éléments constitutifs des systèmes) aux phénotypes (propriétés émergentes des systèmes), en particulier les phénotypes pathologiques. Le groupe est actif dans le domaine de la biologie des systèmes, à travers le développement d’outils mathématiques et computationnels basés sur la théorie des réseaux et leur application à des problématiques biologiques, dans le but ultime de démêler les relations entre génotype et phénotype des maladies humaines.

 

L’équipe de Biomédecine des Systèmes est impliquée dans divers projets locaux, nationaux et internationaux : 

  • À Aix-Marseille Université, au sein des Instituts Marmara, Laënnec et Centuri,
  • Au niveau national, l'équipe participe au programme PEPR Santé Numérique, notamment aux projets M4DI et ai4scmed,
  • À l’international, l'équipe est impliquée dans l’EJP-RD.

Adresse : MMG

Faculté de Médecine

27, Bd Jean Moulin

13385 - Marseille Cedex 05

Téléphone : 04 91 32 49 47

Mail : valerie.gall@univ-amu.fr

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